Umowa z Ministerstwem Spraw Zagranicznych na obsługę spłat kredytów udzielonych w ramach Programów Agrolinia oraz obsługa CPF Sektorowych.
W latach 1990-2004 Fundacja Fundusz Współpracy w ramach kilku programów (Importowa Linia Kredytowa dla Sektora Rolnego, Agrolinia – 2000, Agrolinia oraz Linii dla Małych i Średnich Przedsiębiorstw na Terenach Wiejskich SIP/SME) udzieliła poprzez współpracujące z nią Zrzeszenia Banków Spółdzielczych oraz same Banki Spółdzielcze ponad 3300 kredytów, których adresatem był szeroko rozumiany sektor rolny na kwotę ponad 220 mln złotych.
W chwili obecnej, Fundacja, w imieniu Ministerstwa Spraw Zagranicznych (wcześniej Urzędu Komitetu Integracji Europejskiej) administruje środkami Pomocy Unii Europejskiej, powierzonymi przez sekretarza KIE na podstawie Umowy z dn. 27 października 1997.

